Font fut occupé dès le néolithique et l'âge du bronze. De nombreux objets furent découverts sur la rive du lac de Neuchâtel. La présence de palafittes, de bijoux et d'objets usuels atteste de l'occupation humaine du site. A la pointe du Pillard des monnaies gauloises, des statuettes et des monnaies romaines furent mises au jour. Des pierres à écuelles y furent également trouvées.

C'est à l'époque moyenâgeuse que se développa la seigneurie de Font qui après avoir passé sous la suzeraineté des sires de Glâne, de Gruyères-Montsalvens, des Blonay, resta enfin sous celle des Estavayer-le-Lac-Chenaux jusqu'en 1475. Le château fut alors détruit par les Suisses et les droits de suzeraineté sur Font passèrent à Fribourg. Le manoir seigneurial, dont quelques ruines se voient encore sur un rocher escarpé dominant le lac, faisait partie des biens donnés en 1011 par le roi Rodolphe III de Bourgogne à son épouse Irmengarde.

L'acte l'appelait castellum regale (château princier). Il avait sa chapelle et même encore son chapelain en 1545. Une dépendance du château, ayant échappée à la destruction, servit plus tard de résidence aux baillis (celle qu'à tort on appelle aujourd'hui le château).En 1520, l'état de Fribourg fit de Font, Châbles et Châtillon, un bailliage auquel en 1536, il réunit celui de la Molière; en 1608, on y ajouta encore celui de Vuissens. Vers 1643, Font était au nombre des communes qui avait droit au "grand parcours" qui s'étendait de la Broye au lac de Neuchâtel et des portes de Grandcour au château de Saint-Martin. Font et Châbles forment déjà une paroisse attestée dès 1228.

Font, Châbles et Châtillon formaient autrefois la "grande commune"; sous la République helvétique, ils se partagèrent les biens communaux. En 1802, , une bande de Bourla papeis* envahit le 7 mai la cure de Font et se fit remettre, tous les titres de redevances féodales. Depuis 1803, Font fait partie de la préfecture d'Estavayer-le-Lac.

Essentiellement agricole et vigneron au début du 20è siècle, le village s'est donné peu à peu une vocation résidentielle incontestable du fait de sa situation face au lac. Les zones à bâtir aménagées sont autant de lieux de prédilection pour de nouveaux résidents qui viennent augmenter une population d'environ deux cent huitante habitants. Plus récemment, en collaboration avec d'autres communes, le village s'est doté d'infrastructures adaptées en conduisant à termes maints projets : remaniements parcellaires agricole et forestier, épuration des eaux (STEP), adduction d'eau (GRAC), zones nouvelles d'habitation et d'artisanat, école moderne, bâtiment communal.

*La Révolution avait aboli les redevances dues aux seigneurs, essentiellement les dîmes et les cens, mais on avait décidé que les paysans rachèteraient ces droits à leurs anciens seigneurs que l'on ne voulait pas dépouiller. En 1801, le Directoire helvétique voulut rétablir le paiement des dîmes. L'insurrection paysanne éclata en 1802. Les paysans prirent le château de la Sarraz et brûlèrent les archives qui contenaient les documents fondant les droits féodaux. Les "Bourla Papeis"(Brûle-Papiers) inquiétèrent le pouvoir jusqu'à l'été.